•在幾分鐘內(nèi)從全血中分離白細(xì)胞
• 從白細(xì)胞中提取總 RNA
• 無需額外的球蛋白還原步驟
• 穩(wěn)定 RNA 以保存表達(dá)譜
• 在室溫下保留白細(xì)胞數(shù)天
LeukoLOCK™ 系統(tǒng)經(jīng)過優(yōu)化以與人血配合使用。血液是細(xì)胞信息的存儲(chǔ)庫(kù);然而,使用全血制備的 RNA 中存在球蛋白 mRNA 會(huì)干擾下游表達(dá)譜分析應(yīng)用。LeukoLOCK™ 系統(tǒng)采用基于過濾柱的白細(xì)胞去除技術(shù),將白細(xì)胞從全血和 RNAlater™ 溶液中分離出來,以穩(wěn)定過濾柱上的細(xì)胞。通過排除紅細(xì)胞,從捕獲的白細(xì)胞中純化得到去除固有球蛋白 mRNA 的 RNA,可提高表達(dá)譜分析和其他應(yīng)用的樣品實(shí)用性(如圖所示)。
白細(xì)胞捕獲和穩(wěn)定
將抗凝血的 9–10 mL 樣品通過 LeukoLOCK™ 過濾柱,其可捕獲總白細(xì)胞群,同時(shí)去除紅細(xì)胞(包括網(wǎng)織紅細(xì)胞)、血小板和血漿。用磷酸鹽緩沖鹽水沖洗后,用 RNAlater™ 溶液沖洗過濾柱,以穩(wěn)定捕獲的白細(xì)胞中的 RNA(參見方案示意圖)。RNA 可立即分離,或穩(wěn)定的細(xì)胞可在室溫下放置數(shù)天或在 –20°C 或 –80°C 下放置更長(zhǎng)時(shí)間(如圖所示)。
RNA 分離
首先在基于–硫氰酸胍的溶液(可釋放 RNA,同時(shí)使核酸酶失活)中對(duì)捕獲的細(xì)胞進(jìn)行破壞來純化 RNA。收集細(xì)胞裂解物并用蛋白酶 K 進(jìn)行短暫處理。然后通過以下步驟從裂解物中純化 RNA:使用 MagMAX™ 磁珠法技術(shù)進(jìn)行洗滌,隨后進(jìn)行 DNase 處理(使用 TURBO DNase™)和最終純化。
表達(dá)研究
定量 RT-PCR 和微陣列表達(dá)研究均已驗(yàn)證了純化 RNA 用于可靠轉(zhuǎn)錄組譜分析的適用性(參見圖)。與使用常用的血液 RNA 分離程序處理的 RNA 相比,使用 LeukoLOCK™ 系統(tǒng)分離的 RNA 在擴(kuò)增后產(chǎn)生更長(zhǎng)的中位 aRNA,且存在更高百分比的調(diào)用,無需額外的提取后步驟去除球蛋白 mRNA(參見圖)。由于球蛋白 aRNA 代表全血總 RNA 的 aRNA 峰值的 25–40%,因此,使用去除不需要的球蛋白轉(zhuǎn)錄本的方法時(shí)得到可以理解的較低總 RNA 得率。由于競(jìng)爭(zhēng)的球蛋白轉(zhuǎn)錄本顯著降低,在完成 LeukoLOCK™ 純化后擴(kuò)增的 RNA 會(huì)產(chǎn)生更高的陣列靈敏度。
試劑盒得率
供體之間的回收率有所差異,但通常為 10–20 µg RNA/9–10 mL 全血(如圖所示)。使用 LeukoLOCK™ 系統(tǒng)回收的 RNA 含有低于 1/10 的網(wǎng)織紅細(xì)胞來源的 α- 和 β-球蛋白 mRNA(存在于未分餾全血的典型 RNA 樣品中)。