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賽默飛世爾科技(中國)有限公司


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Oncomine™ 泛癌種液態(tài)活檢試劑盒

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產(chǎn)品型號Ion Torrent

品       牌

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更新時間:2024-08-10 07:43:06瀏覽次數(shù):106次

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經(jīng)營模式:生產(chǎn)廠家

商鋪產(chǎn)品:1324條

所在地區(qū):上海上海市

聯(lián)系人:Tracy (市場)

產(chǎn)品簡介

Oncomine™ 泛癌種液態(tài)活檢試劑盒

詳細(xì)介紹

Oncomine 泛癌無細(xì)胞檢測是檢測從全血血漿漿組分中分離出腫瘤來源 DNA 和 RNA 中多個靶標(biāo)的完整解決方案的一部分。該測定試劑盒提供了試劑,以及用于從單管 10 mL 全血的血漿組分中獲得的無細(xì)胞總核酸 (cfTNA) 制備擴(kuò)增子文庫的一池多重 PCR 引物。該文庫可用于高度多重靶向下一代測序 (NGS)。

Oncomine 無細(xì)胞檢測的優(yōu)勢:
•從單管血液中,使用 DNA 和 RNA 生成擴(kuò)增子文庫,SNV 檢測限為 0.1%
• 適用于短 cfDNA 的優(yōu)化擴(kuò)增子設(shè)計(jì)確??赡茌^高的捕獲率
• 標(biāo)簽測序技術(shù)通過去除隨機(jī)摻入的錯誤,盡可能減少假陽性結(jié)果
• 優(yōu)化的靶向測定試劑盒設(shè)計(jì)可進(jìn)行高度多重 NGS,降低每份樣品的測序成本
• 從單管 10 mL 血液至報告為 2 天工作流程;靶向文庫的總時間僅為 4 小時
• 僅需 5 ng 上樣量 cfTNA 即可進(jìn)行癌癥基因研究
• 與 FFPE 樣品兼容以進(jìn)行可能的一致性研究

52 基因檢測組合包括:
• 熱點(diǎn)基因 (SNV) 和短插入缺失:AKT1、ALK、AR、ARAF、BRAF、CHEK2、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ESR1、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、GNA11、GNAQ、GNAS、HRAS、IDH1、IDH2、KIT、KRAS、MAP2K1、MAP2K2、MET、MTOR、NRAS、NTRK1、NTRK3、PDGFRA、PIK3CA、RAF1、RET、ROS1、SF3B1、SMAD4、SMO
• 基因融合:ALK、BRAF、ERG、ETV1、FGFR1、FGFR2、FGFR3、MET、NTRK1、NTRK3、RET、ROS1
• MET 外顯子 14 跳讀
• 拷貝數(shù)基因 (CNV):CCND1、CCND2、CCND3、CDK4、CDK6、EGFR、ERBB2、FGFR1、FGFR2、FGFR3、MET、MYC
• 腫瘤抑制基因:APC、FBXW7、PTEN、TP53

這些基因在多種癌癥類型中被確定為頻繁突變,包括:膀胱、腦和 CNS、乳房、宮頸、結(jié)腸直腸、子宮內(nèi)膜、食管、胃、頭頸部、腎臟、肝臟、肺、黑色素瘤、卵巢、胰腺、前列腺、肉瘤和甲狀腺。

檢測限:
•SNV/短插入缺失:可實(shí)現(xiàn)低至 0.1% 等位基因頻率 (AF) 的檢測限 (LOD)、靈敏度 >80%、特異性 >98%*
• TP53 全靶 SNV/插入缺失:0.5% AF(查看擴(kuò)增子內(nèi)的所有堿基)
•融合和 MET 外顯子跳讀:可實(shí)現(xiàn)低至 1% 的 LOD
•CNV 靶標(biāo):可檢測低至 1.4 倍的變化

強(qiáng)烈建議使用 MagMAX 無細(xì)胞總核酸分離試劑盒 (A36716) 從全血血漿組分中分離 DNA 和 RNA。

使用標(biāo)簽測序條形碼套件 1-24 或 25-48(貨號分別為 A31830 和 A31847)實(shí)現(xiàn)可擴(kuò)展性和靈活性,用于在 Ion S5 芯片上倍增條形碼樣品。

可以使用 Torrent Suite 軟件 5.2 或更高版本實(shí)現(xiàn) SNV 和短插入缺失分析。為了分析 SNV、短插入缺失、融合和 CNV,需要使用 Ion Reporter 軟件 5.6(基于云或服務(wù)器)。

技術(shù)
cfDNA 和 cfRNA 在全血血漿組分中濃度極低。由于此低發(fā)病率,所以該檢測中采用了標(biāo)簽測序技術(shù)。該技術(shù)將的分子標(biāo)簽連接至基因特異性引物上。擴(kuò)增后,將根據(jù)標(biāo)簽對已標(biāo)記分子進(jìn)行分組。在 80% 或更長的時間含有相同突變體的組將被稱為陽性。使用該標(biāo)簽技術(shù),通過文庫構(gòu)建/測序過程生成的隨機(jī)錯誤序列能夠被清除。

與 LOD 為 1-5% 的其他技術(shù)不同,Oncomine 泛癌無細(xì)胞測定試劑盒針對 SNV 具有低至 0.1% 的靈活檢測限或在 1,000 個野生型拷貝背景中具有 1 個突變體拷貝。為了達(dá)到 0.1% LOD,需要 20 ng cfTNA 上樣量。cfTNA 用量可以更低,但 %LOD 將更高,這取決于上樣量。

液體活檢相對于傳統(tǒng)實(shí)體瘤活檢具有幾大優(yōu)勢:
•液體活檢采樣采用微創(chuàng),可在多個時間點(diǎn)采集樣品以監(jiān)測癌癥進(jìn)展
• 比傳統(tǒng)組織活檢成本更低
• 從采樣至得到結(jié)果的周轉(zhuǎn)時間更短
• 更好地表示腫瘤異質(zhì)性

*使用從正常健康供體中分離的人工陽性樣品和 cfTNA,測定各變體類型的敏感性和特異性。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.


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